home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00438 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.7 KB  |  58 lines
  1. ********************************************
  2. * Ras GTPase-activating proteins signature *
  3. ********************************************
  4.  
  5. Ras proteins are membrane-associated molecular switches that  bind GTP and GDP
  6. and slowly hydrolyze GTP to GDP [1].  This intrinsic GTPase activity of ras is
  7. stimulated by a family of proteins  collectively  known  as  'GAP'  or GTPase-
  8. activating proteins [2].   As it is the GTP bound form of ras which is active,
  9. these proteins    are  said  to  be  down-regulators of ras. Proteins known to
  10. possess such activity are listed below:
  11.  
  12.  - Mammalian GAP. GAP can down-regulate wild-type ras, but fails to do so with
  13.    oncogenic, mutated ras.
  14.  - IRA1 and IRA2, the functional equivalents of  GAP in yeast.  They  regulate
  15.    the RAS-cyclic AMP pathway, controlling cell growth.
  16.  - sar1, the fission yeast protein that regulates ras1 in that organism.
  17.  - BUD2, a yeast protein that activates BUD1/RSR1  and  which  participates in
  18.    the regulation of bud-site selection [3].
  19.  - Human  neurofibromin  (gene NF1)  [4].   NF1  is  associated  with  type  1
  20.    neurofibromatosis, one  of the  most  frequently inherited genetic diseases
  21.    characterized, in  part,  by multiple neural tumors.  NF1  has  been  shown
  22.    genetically and biochemically  to  interact with  and  stimulate the GTPase
  23.    activity of h-ras.
  24.  - Drosophila  Gap1  [5],  which acts as a negative regulator of signalling by
  25.    the Sevenless receptor tyrosine kinase involved in eye development.
  26.  
  27. All the above proteins are quite large  (from  765  residues  for sar1 to 3079
  28. residues for IRA2)  but  share  only  a limited (about 250 residues) region of
  29. sequence similarity, referred to as the 'catalytic domain'. The most conserved
  30. region within  this domain contains a  12  residue  motif  which  seems  to be
  31. characteristic of this family of proteins [2].
  32.  
  33. -Consensus pattern: F-L-R-x(3)-P-[AV]-x(3)-P
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  35. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  36.  
  37. -Note: there are distinctly different GAPs for the rap and rho/rac subfamilies
  38.  of ras-like proteins (reviewed in reference [6]) that  do  not share sequence
  39.  similarity with ras GAPs.
  40.  
  41. -Expert(s) to contact by email: Boguski M.S.
  42.                                 boguski@ncbi.nlm.nih.gov
  43.  
  44. -Last update: June 1994 / Text revised.
  45.  
  46. [ 1] Bourne H.R., Sanders D.A., McCormick F.
  47.      Nature 349:117-127(1991).
  48. [ 2] Wang Y., Boguski M.S., Riggs M., Rodgers L., Wigler M.
  49.      Cell Regul. 2:453-465(1991).
  50. [ 3] Park H.O., Chant J., Herskowitz I.
  51.      Nature 365:269-274(1993).
  52. [ 4] Downward J.
  53.      Curr. Biol. 1:353-355(1991).
  54. [ 5] Gaul U., Mardon G., Rubin G.M.
  55.      Cell 68:1007-1019(1992).
  56. [ 6] Boguski M.S., McCormick F.
  57.      Nature 366:643-654(1993).
  58.